Imunoinformática e desenvolvimento de vacinas

A imunoinformática é uma nova área de pesquisa que utiliza ferramentas de bioinformática para estudar, simular e prever, etapas e mecanismos envolvidos na resposta imune. Este núcleo de pesquisa em bioinformática, criado pelo laboratório de Imunogenética e coordenado pelos bolsistas de Pós-Doutorado (PNPD) Gustavo Fioravanti Vieira e Marialva Sinigaglia, tem como foco de estudo os mecanismos imunes realizados em resposta à infecções virais e a identificação de possíveis padrões presentes em epitopos que possam ser reconhecidos como alvos virais.

Em 2009 o grupo teve um projeto aprovado no “Grand Challenges Explorations” da fundação Bill & Melinda Gates, tendo recebido um auxílio de U$ 100.000 dólares para desenvolver a pesquisa. Este projeto, intitulado "Large-Scale MHC:Epitope Analysis for Vaccine Development", guia as pesquisas do grupo e levanta a possibilidade da identificação de padrões na apresentação de peptídeos virais, os quais poderiam ser aplicados no desenvolvimento de vacinas antivirais de amplo espectro.

segunda-feira, 25 de fevereiro de 2013

I Curso de Redação Científica


Estão abertas as inscrições para o I Curso de Redação Científica organizado pela Representação Discente do Programa de Pós-graduação em Genética e Biologia Molecular (PPGBM-UFRGS). De acordo com a informação publicada no blog do evento, o curso será ministrado pelo professor Gilson Volpato, da UNESP, tendo como objetivo preparar os alunos para o uso de um método lógico de redação científica.

O I Curso de Redação Científica do PPGBM-UFRGS será realizado nos dias 15 e 16 de abril de 2013, das 8h30min às 12h30min e das 14h às 18h, no anfiteatro do Departamento de Genética da UFRGS. Maiores informações no blog do evento ou pelo e-mail cursoppgbm@gmail.com.

sábado, 16 de fevereiro de 2013

Publicado o artigo do CrossTope!


Foi disponibilizado nesta semana no PubMed o artigo do banco de dados CrossTope. O trabalho foi publicado na Revista Database (Oxford Journals), podendo ser acessado na íntegra de forma gratuita. Este artigo oficializa a existência do banco de dados que é o principal resultado do projeto financiado pela Fundação Bill & Melinda Gates, conforme apresentado em uma postagem anterior deste blog. O site do repositório está online desde 2010, permitindo acesso a imagens de topologia e distribuição de cargas, manipulação e download de estruturas no formato PDB, bem como a comparação online de complexos pMHC. Também são fornecidos links para outros bancos, contendo informações completas sobre o peptídeo e sobre o alelo de MHC envolvidos em cada complexo. A imagem acima apresenta o logo original do banco, que foi posteriormente modificado para a versão online.

O artigo retoma o processo de montagem de complexos segundo a técnica desenvolvida pelo NBLI (D1-EM-D2), a qual é apresentada de forma simplificada na Figura 1 do paper. Esta metodologia é utilizada para a inclusão no banco de complexos pMHC que ainda não possuem uma estrutura tridimensional determinada por Cristalografia de Raio-X ou Ressonância Magnética Nuclear. O trabalho descreve ainda os critérios de inclusão de complexos no banco e todos os passos da curagem da informação que será disponibilizada (Figura 3 do artigo).

O grupo trabalha agora no desenvolvimento de ferramentas que serão posteriormente incluídas no site do Crosstope, permitindo a montagem e a análise de complexos de forma simples, rápida e automatizada.

domingo, 3 de fevereiro de 2013

Seleção de IC no NBLI:

O Núcleo de Bioinformática do Laboratório de Imunogenética (NBLI) está selecionando bolsistas de Iniciação Científica. O trabalho de pesquisa do bolsista será multidisciplinar, consistindo no uso de ferramentas de bioinformática para o estudo da resposta imunológica contra vírus, com enfoque em imunidade celular e desenvolvimento de vacinas.

Confira abaixo os requisitos e as datas:

REQUISITOS:
- Disponibilidade de 20h semanais.
- Interesse nos temas de pesquisa e no uso de ferramentas da informática.
- Possuir cadastro na Plataforma Lattes (desejável).
- Ter noções de informática (desejável).
- Estar familiarizado com Linux (desejável).
- Ter experiência com a linguagem Matlab (desejável).

CRONOGRAMA:
- Os interessados devem entrar em contato pelo e-mail imunoinfo@gmail.com até o dia 16/02/2013. É aconselhável que se encaminhe em anexo uma cópia do currículo e do histórico escolar (graduação).
- Entrevistas presenciais serão agendadas entre os dias 18 e 20 de Fevereiro de 2013.

VAGAS:
- Uma vaga com bolsa de Iniciação Científica da FAPERGS;

Maiores informações pelo e-mail imunoinfo@gmail.com ou pelo telefone 3308-9938.

sábado, 2 de fevereiro de 2013

Abertas as Incrições para a reunião anual da SBBq

 

Estão abertas as inscrições para a 42ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, a realizar-se entre os dias 18 e 21 de maio de 2013, na cidade de Foz do Iguaçu (Paraná). O cronograma completo ainda não foi divulgado, mas a organização do evento confirmou a presença do Dr. John Walker (prêmio Nobel de Química em 1997 e atual diretor do Mitochondrial Biology Unit em Cambridge, UK).

Os resumos deverão ser encaminhados até o dia 28/02/2013, mediante pagamento da inscrição. Veja abaixo o quadro com os valores de inscrição:

CATEGORIA
TAXA DE PAGAMENTO (R$)
INSCRIÇÃO até 28/02/2013
INSCRIÇÃO a partir de 01/03/2013
Membro Ordinário
650,00
650,00
Membro Associado
500,00
500,00
Pesquisadores Seniors, Pós Doutores e Recém Doutores (não membros), outros profissionais
750,00
750,00
Estudante de Pós-graduação (mestrado e doutorado não membro)*
350,00
400,00
Estudante de Iniciação Científica
325,00
375,00
Acompanhante**
330,00
350,00

Maiores informações no página do evento e na página da SBBq. Dúvidas sobre o envio de resumos podem ser encaminhadas para o e-mail congress@sbbq.org.br.