Imunoinformática e desenvolvimento de vacinas

A imunoinformática é uma nova área de pesquisa que utiliza ferramentas de bioinformática para estudar, simular e prever, etapas e mecanismos envolvidos na resposta imune. Este núcleo de pesquisa em bioinformática, criado pelo laboratório de Imunogenética e coordenado pelos bolsistas de Pós-Doutorado (PNPD) Gustavo Fioravanti Vieira e Marialva Sinigaglia, tem como foco de estudo os mecanismos imunes realizados em resposta à infecções virais e a identificação de possíveis padrões presentes em epitopos que possam ser reconhecidos como alvos virais.

Em 2009 o grupo teve um projeto aprovado no “Grand Challenges Explorations” da fundação Bill & Melinda Gates, tendo recebido um auxílio de U$ 100.000 dólares para desenvolver a pesquisa. Este projeto, intitulado "Large-Scale MHC:Epitope Analysis for Vaccine Development", guia as pesquisas do grupo e levanta a possibilidade da identificação de padrões na apresentação de peptídeos virais, os quais poderiam ser aplicados no desenvolvimento de vacinas antivirais de amplo espectro.

quinta-feira, 9 de agosto de 2012

Curso de Bioinformática Estrutural Básica - CANCELADO

O Campus Universitário da Região dos Vinhedos (CARVI) da Universidade de Caxias do Sul (UCS) promoverá entre os dias 22 e 29 de Setembro de 2012 o Curso de Bioinformática Estrutural Básica. O curso será ministrado pelos PhDs Gustavo Fioravanti Vieira e Marialva Sinigaglia, do Núcleo de Bionformática do Laboratório de Imunogenética (PPGBM/UFRGS). A carga horária total será de 14 horas e as aulas ocorrerão aos sábados, das 8h às 11h30 e das 14h às 17h30. As vagas são limitadas e as inscrições estarão disponíveis até completar-se o número de vagas previstas (25), havendo ainda uma lista de espera para os demais candidatos.

Confira o programa do curso:

Bancos de dados biológicos - Enfoque nos principais bancos de dados utilizados para a modelagem de proteínas.
Alinhamento de sequencias de proteínas - Conhecimentos básicos de matrizes de alinhamento e alinhamento local e global utilizando programas como BLAST e T-coffee;
Visualização de macromoléculas utilizando o Chimera - Aprender a utilizar um software de visualização de moléculas 3D. O software Chimera permite a visualização e análise de estruturas moleculares. Imagens de alta qualidade e animações serão produzidas com o material gerado durante o curso.
Modelagem molecular por homologia - Construção de um modelo tridimensional de uma proteína que ainda não possui cristal, utilizando-se o software HHPRED.
Visualização e avaliação dos modelos gerados - Utilizando os softwares CHIMERA, PDBSUM e VERIFY 3D, os modelos serão validados quanto às suas características estereoquímicas e energéticas.

Para maiores informações, confira a página de divulgação do curso: UCS/Agenda.

NOTA: O Curso de Bioinformática Estrutural que seria oferecido no CARVI foi cancelado em função do pequeno número de alunos inscritos.

quarta-feira, 1 de agosto de 2012

Bioinformática Estrutural na ABC!


Em cerimônia realizada hoje (01/08/2012) no Salão do Departamento de Genética do Instituto de Biociências (UFRGS), a Academia Brasileira de Ciências (ABC) apresentou seus novos membros afiliados. Um dos jovens pesquisadores diplomados na ocasião foi o Prof. Dr. Hugo Verli, coordenador do Grupo de Bioinformática Estrutural do Centro de Biotecnologia da UFRGS (CBiot/UFRGS). Em sua palestra, o Dr. Verli salientou a importância do estudo da estrutura tridimensional das macromoléculas biológicas, com ênfase na análise de glicoproteínas. O Grupo de Bioinformática Estrutural tem se destacado no campo da dinâmica molecular de estruturas glicosiladas, com vários artigos publicados em importantes revistas internacionais.

Veja a lista dos novos diplomados na região sul e o título de suas apresentações:

Paulo Schneider – Compostos derivados de calcogênio: síntese e aplicações. 
Hugo Verli – Estrutura, conformação e função de macromoléculas biológicas. 
Monica R.M.R. Vianna – Alterações sinápticas, aprendizagem e neurodegeneração em animais experimentais.
Juliano Ferreira – Mecanismos bioquímicos e moleculares na dor aguda e crônica. 
Adeney F. Bueno – Manejo integrado de pragas através do controle biológico.