Imunoinformática e desenvolvimento de vacinas

A imunoinformática é uma nova área de pesquisa que utiliza ferramentas de bioinformática para estudar, simular e prever, etapas e mecanismos envolvidos na resposta imune. Este núcleo de pesquisa em bioinformática, criado pelo laboratório de Imunogenética e coordenado pelos bolsistas de Pós-Doutorado (PNPD) Gustavo Fioravanti Vieira e Marialva Sinigaglia, tem como foco de estudo os mecanismos imunes realizados em resposta à infecções virais e a identificação de possíveis padrões presentes em epitopos que possam ser reconhecidos como alvos virais.

Em 2009 o grupo teve um projeto aprovado no “Grand Challenges Explorations” da fundação Bill & Melinda Gates, tendo recebido um auxílio de U$ 100.000 dólares para desenvolver a pesquisa. Este projeto, intitulado "Large-Scale MHC:Epitope Analysis for Vaccine Development", guia as pesquisas do grupo e levanta a possibilidade da identificação de padrões na apresentação de peptídeos virais, os quais poderiam ser aplicados no desenvolvimento de vacinas antivirais de amplo espectro.

sábado, 19 de outubro de 2013

Prorrogado prazo para seleção de bolsista na área de Bioinformática!!


O NBLI está selecionando bolsistas de Iniciação Científica (IC) para trabalhar no uso de ferramentas de bioinformática voltadas ao estudo da resposta imunológica contra vírus, com enfoque em imunidade celular e desenvolvimento de vacinas. O bolsista deverá atuar sobretudo em projetos vinculados ao CrossTope, um banco de dados desenvolvido pela equipe do NBLI com financiamento da Bill & Melinda Gates Foundation, obtido através da segunda edição do Grand Challenges Explorations (GCE) in Global Health. O CrossTope armazena estruturas, modelos e imagens do potencial eletrostático de proteínas do sistema imunológico (MHCs), envolvidas na apresentação e reconhecimento de alvos virais. Apenas uma vaga será aberta neste momento e o candidato selecionado receberá uma bolsa de Iniciação Científica da FAPERGS no valor de R$ 400,00.


 Confira abaixo os requisitos e as datas:

REQUISITOS:

- Interesse nos temas de pesquisa e no uso de ferramentas da informática.

- Disponibilidade de até 20h semanais.

- Possuir cadastro na Plataforma Lattes (desejável).

- Ter noções de informática e estar familiarizado com o sistema Linux (desejável).

- Ter experiência com algumas das seguintes linguagens: MySQL, PHP, HTML, R, Python (desejável).

CRONOGRAMA:

- Os interessados devem entrar em contato pelo e-mail imunoinfo@gmail.com até o dia 17/11/2013. É aconselhável que se encaminhe em anexo uma cópia do currículo e do histórico escolar (graduação).

- Entrevistas presenciais serão agendadas por e-mail.

terça-feira, 9 de abril de 2013

Simpósio de aniversário do CTG

Estão abertas as inscrições para o Simpósio Comemorativo aos 10 anos do Centro de Terapia Gênica (CTG) do Hospital de Clínicas de Porto Alegre. O evento ocorrerá nos dias 3 e 4 de Maio no próprio HCPA. Maiores informações e inscrições pelo site da Fundação Médica.


terça-feira, 19 de março de 2013

50 anos do PPGBM

Em cerimônia realizada na tarde desta segunda-feira (18/03/2013) foi celebrado o início das atividades comemorativas ao cinquentenário da Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular (PPGBM). Estavam presentes autoridades da Universidade, bem como professores, alunos e egressos do programa. Na cerimônia foram exaltados os números do programa, que cresceu muito durante a última década (em número de mestrandos e doutorandos formados ao ano), sempre mantendo um alto nível de qualidade no ensino (CAPES 7) e na pesquisa. Atualmente o curso conta com 40 alunos de mestrado e 87 alunos de doutorado. O caráter inovador e vanguardista da Pós-Graduação em genética também foi relembrado. Este foi o primeiro curso de Pós-Graduação da UFRGS e um dos primeiros cursos de Pós-Graduação em genética do Brasil. 

A data também marca o lançamento de um número especial da Genetics and Molecular Biology (GMB), em comemoração aos 50 anos do PPGBM. Os artigos, redigidos por professores e alunos do programa, podem ser conferidos no SCIELO através do link.

Durante o evento, o vice coordenador do PPGBM, professor Claiton Henrique Dotto Bau, convidou os presentes a visitarem o novo "Museu da Genética", um projeto em desenvolvimento que já conta com um belo acervo, incluindo fotos, documentos, depoimentos, etc. Vinculado a este projeto, foi lançado recentemente o documentário "Efeito Fundador", que pode ser conferido na íntegra através do link. Uma fantástica viagem através da história da genética e da pesquisa no Brasil.

segunda-feira, 25 de fevereiro de 2013

I Curso de Redação Científica


Estão abertas as inscrições para o I Curso de Redação Científica organizado pela Representação Discente do Programa de Pós-graduação em Genética e Biologia Molecular (PPGBM-UFRGS). De acordo com a informação publicada no blog do evento, o curso será ministrado pelo professor Gilson Volpato, da UNESP, tendo como objetivo preparar os alunos para o uso de um método lógico de redação científica.

O I Curso de Redação Científica do PPGBM-UFRGS será realizado nos dias 15 e 16 de abril de 2013, das 8h30min às 12h30min e das 14h às 18h, no anfiteatro do Departamento de Genética da UFRGS. Maiores informações no blog do evento ou pelo e-mail cursoppgbm@gmail.com.

sábado, 16 de fevereiro de 2013

Publicado o artigo do CrossTope!


Foi disponibilizado nesta semana no PubMed o artigo do banco de dados CrossTope. O trabalho foi publicado na Revista Database (Oxford Journals), podendo ser acessado na íntegra de forma gratuita. Este artigo oficializa a existência do banco de dados que é o principal resultado do projeto financiado pela Fundação Bill & Melinda Gates, conforme apresentado em uma postagem anterior deste blog. O site do repositório está online desde 2010, permitindo acesso a imagens de topologia e distribuição de cargas, manipulação e download de estruturas no formato PDB, bem como a comparação online de complexos pMHC. Também são fornecidos links para outros bancos, contendo informações completas sobre o peptídeo e sobre o alelo de MHC envolvidos em cada complexo. A imagem acima apresenta o logo original do banco, que foi posteriormente modificado para a versão online.

O artigo retoma o processo de montagem de complexos segundo a técnica desenvolvida pelo NBLI (D1-EM-D2), a qual é apresentada de forma simplificada na Figura 1 do paper. Esta metodologia é utilizada para a inclusão no banco de complexos pMHC que ainda não possuem uma estrutura tridimensional determinada por Cristalografia de Raio-X ou Ressonância Magnética Nuclear. O trabalho descreve ainda os critérios de inclusão de complexos no banco e todos os passos da curagem da informação que será disponibilizada (Figura 3 do artigo).

O grupo trabalha agora no desenvolvimento de ferramentas que serão posteriormente incluídas no site do Crosstope, permitindo a montagem e a análise de complexos de forma simples, rápida e automatizada.

domingo, 3 de fevereiro de 2013

Seleção de IC no NBLI:

O Núcleo de Bioinformática do Laboratório de Imunogenética (NBLI) está selecionando bolsistas de Iniciação Científica. O trabalho de pesquisa do bolsista será multidisciplinar, consistindo no uso de ferramentas de bioinformática para o estudo da resposta imunológica contra vírus, com enfoque em imunidade celular e desenvolvimento de vacinas.

Confira abaixo os requisitos e as datas:

REQUISITOS:
- Disponibilidade de 20h semanais.
- Interesse nos temas de pesquisa e no uso de ferramentas da informática.
- Possuir cadastro na Plataforma Lattes (desejável).
- Ter noções de informática (desejável).
- Estar familiarizado com Linux (desejável).
- Ter experiência com a linguagem Matlab (desejável).

CRONOGRAMA:
- Os interessados devem entrar em contato pelo e-mail imunoinfo@gmail.com até o dia 16/02/2013. É aconselhável que se encaminhe em anexo uma cópia do currículo e do histórico escolar (graduação).
- Entrevistas presenciais serão agendadas entre os dias 18 e 20 de Fevereiro de 2013.

VAGAS:
- Uma vaga com bolsa de Iniciação Científica da FAPERGS;

Maiores informações pelo e-mail imunoinfo@gmail.com ou pelo telefone 3308-9938.

sábado, 2 de fevereiro de 2013

Abertas as Incrições para a reunião anual da SBBq

 

Estão abertas as inscrições para a 42ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, a realizar-se entre os dias 18 e 21 de maio de 2013, na cidade de Foz do Iguaçu (Paraná). O cronograma completo ainda não foi divulgado, mas a organização do evento confirmou a presença do Dr. John Walker (prêmio Nobel de Química em 1997 e atual diretor do Mitochondrial Biology Unit em Cambridge, UK).

Os resumos deverão ser encaminhados até o dia 28/02/2013, mediante pagamento da inscrição. Veja abaixo o quadro com os valores de inscrição:

CATEGORIA
TAXA DE PAGAMENTO (R$)
INSCRIÇÃO até 28/02/2013
INSCRIÇÃO a partir de 01/03/2013
Membro Ordinário
650,00
650,00
Membro Associado
500,00
500,00
Pesquisadores Seniors, Pós Doutores e Recém Doutores (não membros), outros profissionais
750,00
750,00
Estudante de Pós-graduação (mestrado e doutorado não membro)*
350,00
400,00
Estudante de Iniciação Científica
325,00
375,00
Acompanhante**
330,00
350,00

Maiores informações no página do evento e na página da SBBq. Dúvidas sobre o envio de resumos podem ser encaminhadas para o e-mail congress@sbbq.org.br.