Imunoinformática e desenvolvimento de vacinas
A imunoinformática é uma nova área de pesquisa que utiliza ferramentas de bioinformática para estudar, simular e prever, etapas e mecanismos envolvidos na resposta imune. Este núcleo de pesquisa em bioinformática, criado pelo laboratório de Imunogenética e coordenado pelos bolsistas de Pós-Doutorado (PNPD) Gustavo Fioravanti Vieira e Marialva Sinigaglia, tem como foco de estudo os mecanismos imunes realizados em resposta à infecções virais e a identificação de possíveis padrões presentes em epitopos que possam ser reconhecidos como alvos virais.
Em 2009 o grupo teve um projeto aprovado no “Grand Challenges Explorations” da fundação Bill & Melinda Gates, tendo recebido um auxílio de U$ 100.000 dólares para desenvolver a pesquisa. Este projeto, intitulado "Large-Scale MHC:Epitope Analysis for Vaccine Development", guia as pesquisas do grupo e levanta a possibilidade da identificação de padrões na apresentação de peptídeos virais, os quais poderiam ser aplicados no desenvolvimento de vacinas antivirais de amplo espectro.
segunda-feira, 27 de fevereiro de 2012
BSB 2012
Publicações do grupo:
- New Insights into the In Silico Prediction of HIV Protease Resistance to Nelfinavir
- Genetic changes in severe haemophilia A: new contribution to the aetiology of a complex disease.
- Detection of new mutations and molecular pathology of mild and moderate haemophilia A patients from southern Brazil.
- Induced genome maintenance pathways in pre-cancer tissues describe an anti-cancer barrier in tumor development.
- CrossTope: a curate repository of 3D structures of immunogenic peptide:MHC complexes
- Immunogenic epitopes of Hantaviruses' N protein are restricted to conserved regions
- Structural in silico analysis of cross-genotype-reactivity among naturally occurring HCV NS3-1073-variants in the context of HLA-A*02:01 allele.
- Molecular Aspects Involved In The Immunogenicity Against Viral Epitopes - An Immunoinformatic Perspective. (Book Chapter)
- Uso de Ferramentas de Bioinformática para estudo "in silico" de reatividade cruzada (CESUP - Revista de 2011)
- Reconstruction of MHC alleles by cross modeling and structural assessment.(BIOCOMP'10, USA, 2010.)
- Structural Allele-Specific Patterns Adopted by Epitopes in the MHC-I Cleft and Reconstruction of MHC:peptide Complexes to Cross-Reactivity Assessment
- MHC: Peptide Analysis: Implications on the Immunogenicity of Hantaviruses’ N protein
- Analysis of expression pathways alterations of Arabidopsis thaliana induced by a Necrosis- and Ethylene-inducing protein
- ViaComplex: software for landscape analysis of gene expression networks in genomic context
- Immunodominant viral peptides as determinants of cross-reactivity in the immune system – Can we develop wide spectrum viral vaccines?
Cursos ministrados:
- Uso de ferramentas de bioinformática na predição de epitopos de células T e B". (Fiocruz-Centro de Pesquisas René Rachou. Novembro de 2009)
- Modelagem Básica de Proteínas. (Universidade do Pampa – Unipampa, Junho de 2009.)
- Ferramentas de Bioinformática aplicadas ao Desenvolvimento de Vacinas - Segunda Edição (2009)
- O Papel da Bioinformática no Desenvolvimento de Novas Estratégias Vacinais
- Ferramentas de Bioinformática Aplicadas no Desenvolvimento de Vacinas